Прво је Канцеларија Владе ФБиХ за законодавство и усклађеност с прописима ЕУ. Овај одјел сарађује с именованим координаторима за ЕУ (државни службеници) који су запослени у министарствима у оквиру Владе ФБиХ. Канцеларија је примарно усмјерена на преглед нацрта законских аката/подзаконских аката прије него што се прослиједе Влади ФБиХ, а у смислу њихове усклађености с правном тековином ЕУ, Уставом ФБиХ и правним системом ФБиХ. Друго тијело Владе ФБиХ, Канцеларија Владе ФБиХ за европске интеграције, успостављена је крајем 2013. године (Уредба о Канцеларији Владе ФБиХ за европске интеграције, објављена у Службеним новинама ФБиХ 13. новембра 2013. године, бр. 89/2013).
Ова Канцеларија Владе Федерације има именованог директора и минималан број чланова особља које чини неколико стручних савјетника. Даљи развој канцеларије и упошљавање додатног квалификованог особља зависи од одлука Владе ФБиХ. Подзаконски акти Канцеларије су припремљени у јануару 2014. године.